De plus…
Schéma du mode de fonctionnement du biocapteur.
L'identification et la quantification de bactéries sont également d'intérêt dans plusieurs marchés autres que l'agroalimentaire, tels que la sécurité et la défense, l'environnement et la pharmaceutique.
Une évaluation comparative en trois phases
Afin de valider l'approche « microarray » de protéines pour la détection des pathogènes, nous avons réalisé des tests pour déterminer le seuil de détection, la spécificité et l'amplification nécessaire. Cinq anticorps commerciaux anti-Salmonelles ont été imprimés sur des lames. Huit dilutions de Salmonelles allant de 1,2 x 106 à 1,2 x 106
ont été déposées, en quatre exemplaires, sur les lames. Cette première étape a permis de déterminer que la limite de détection de notre prototype est inférieure, 1,2 x 10 6 comparativement à 1,2 x 106, et que la variation entre les lectures est moindre que le lecteur à « microarray » commercial utilisé pour les besoins de la comparaison. De plus, les lecteurs actuellement sur le marché sont en moyenne 10 fois plus coûteux que celui de l’INO.
Dans la seconde phase de validation, d'autres bactéries ont été ajoutées à des concentrations connues de Salmonelles avant de déposer les échantillons sur les lames. Ce test a permis de confirmer que la présence d'autres bactéries ne nuisait pas à la détection spécifique des Salmonelles. Étant donné qu’aucune réaction croisée n’a été observée, l'amplification spécifique des Salmonelles n'est donc pas requise.
La troisième et dernière phase des travaux de validation a consisté à déterminer le temps d'amplification nécessaire à la détection des Salmonelles avec le biocapteur développé à l'INO. Dans ce test, 10 UFC (unité formant colonie) de Salmonelles ont été ajoutées à 25 grammes de poulet broyé et elles ont été préamplifiées en respectant un protocole actuellement en vigueur au sein de l'industrie agroalimentaire. Ces tests nous ont permis de déterminer que le temps total d'analyse se situait entre 6 et 18 heures, comparativement à plus de 48 heures avec la méthode d'analyse de microbiologie actuelle.
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